下载templateflow

templateflow中包含了一些典型的神经影像脑模版，可在fmriprep等工具中使用。本文主要介绍如何下载templateflow。

准备
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GitHub上有它的仓库，但是那只是DataLab的索引，因此直接下载是不能下载到模版文件的。需要通过DataLab下载。

首先，安装DataLab（以Ubuntu 21.10为例）。

conda install -c conda-forge datalad
# OR
sudo apt-get install datalab

下载索引文件，并使用DataLab下载模版。

git clone https://github.com/templateflow/templateflow.git
cd templateflow
# tpl-* 下载所有模版
datalad get -r tpl-fsLR

笔者在使用datalad下载过程中，会经常遇到进度条长时间不动的情况。而且印象当中，笔者以前用python下载成功过，速度也不是很慢。因此这里将python下载templateflow的方法也追加进来。

首先设置环境变量。

export TEMPLATEFLOW_HOME=$HOME/.templateflow

使用pip安装templateflow包。

python -m pip install -U templateflow

下载templateflow。

python -c "from templateflow.api import get; get(['MNI152NLin2009cAsym', 'MNI152NLin6Asym', 'OASIS30ANTs', 'MNIPediatricAsym', 'MNIInfant'])"

这里可以根据需要下载相应的模版文件。