https://isangfeng.github.io/tags/t1w/Recent content in T1w on 桑峰Hugo -- gohugo.iozh-cn© 2026 桑峰Fri, 11 Mar 2022 00:00:00 +0000https://isangfeng.github.io/posts/2022/2022-03-11-freesurfer/Fri, 11 Mar 2022 00:00:00 +0000https://isangfeng.github.io/posts/2022/2022-03-11-freesurfer/<h2 class="relative group">Outputs <div id="outputs" class="anchor"></div> <span class="absolute top-0 w-6 transition-opacity opacity-0 -start-6 not-prose group-hover:opacity-100 select-none"> <a class="text-primary-300 dark:text-neutral-700 !no-underline" href="#outputs" aria-label="锚点">#</a> </span> </h2> <p>FreeSurfer首先去除颅骨（stripped skull），生成brainmask.mgz文件，并进一步分出灰质、白质和皮下结构，保存在aseg.mgz文件中。与此同时，得到白质/灰质的初步估计（?h.orig），随后对分界面进行进一步的调整得到?j.white。在?h.white的基础上，分界面继续向外膨胀得到?h.pial，并进一步膨胀得到?h.inflated。?h.sphere为?h.inflated膨胀形成的球面。可以用来与其他空间图像进行配准（例如fsaverage）。</p>